Fráveita bæjarins er í umsjá þjónustumiðstöðvar Ísafjarðarbæjar. Tvöfalt fráveitukerfi er í öllum nýjum hverfum bæjarins, en einfalt kerfi er í gömlum hverfum. Rotþró er við Holtahverfi og Seljalandshverfi, en eftir föngum verður stefnt að tengingu þessara bæjarhluta við stofnlagnir fráveitunnar. 

Frekari upplýsingar veitir Þjónustumiðstöð Ísafjarðarbæjar (áhaldahús).